يستمد المجري مياهيه من مرتفعات نابلس-رام الله-القدس والأرض السهلية من القسم الأوسط للسهل الساحلي، ويأتي في المركز الثاني من حيث أهميتة المائية في فلسطين بعد نهر الأردن، حيث تغطي مساحة حوضه 1752كم2، ويصل طوله إلى 25كم من رأس العين حتي البحر المتوسط وبلغ تصريفه السنوي 220م3.